| Prov-id | Provtyp | Mediansekvensdjup [x] | Fold 80 base penalty | Fragmentlängd, medel [baspar] |
|---|---|---|---|---|
| normal | KS656 | 597.0 | 1.47 | 125.82 |
| tumor | KS454 | 805.0 | 1.57 | 131.28 |
| Prov-id | Provtyp | Täckningsgrad [50X] | Täckningsgrad [100X] | Täckningsgrad [200X] | Täckningsgrad [500X] | Täckningsgrad [1000X] |
|---|---|---|---|---|---|---|
| normal | KS656 | 99.84 % | 99.5 % | 97.72 % | 67.94 % | 8.52 % |
| tumor | KS454 | 99.86 % | 99.72 % | 98.72 % | 87.46 % | 30.44 % |
Värdena presenterade för Mediansekvensdjup och Täckningsgrad är efter borttagning av duplikata läsningar.
Mediansekvensdjup: Median av sekvenseringsdjup över alla baser inkluderade i analyspanelen.
Fold 80 base penalty: Jämnhet av täckningsgraden över alla gener i analyspanlen. Ett värde mellan 1.0-1.8 visar god jämnhet.
Fragmentlängd, medel: Medelstorlek av provbiblioteken som laddats på sekvenseringsinstrument. <200bp kan tyda på degraderade provmaterial (t.ex. FFPE), innan biblioteksberedning.
Täckningsgrad: Andel baser som är sekvenserade med ett djup över en specificerad gräns, t.ex. 100X.