Stan Math Library  2.12.0
reverse mode automatic differentiation
jacobian.hpp
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1 #ifndef STAN_MATH_FWD_MAT_FUNCTOR_JACOBIAN_HPP
2 #define STAN_MATH_FWD_MAT_FUNCTOR_JACOBIAN_HPP
3 
4 #include <stan/math/fwd/core.hpp>
6 #include <vector>
7 
8 namespace stan {
9  namespace math {
10 
11  template <typename T, typename F>
12  void
13  jacobian(const F& f,
14  const Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, 1>& x,
15  Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, 1>& fx,
16  Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic>& J) {
17  using Eigen::Matrix;
18  using Eigen::Dynamic;
19  Matrix<fvar<T>, Dynamic, 1> x_fvar(x.size());
20  for (int i = 0; i < x.size(); ++i) {
21  for (int k = 0; k < x.size(); ++k)
22  x_fvar(k) = fvar<T>(x(k), i == k);
23  Matrix<fvar<T>, Dynamic, 1> fx_fvar
24  = f(x_fvar);
25  if (i == 0) {
26  J.resize(fx_fvar.size(), x.size());
27  fx.resize(fx_fvar.size());
28  for (int k = 0; k < fx_fvar.size(); ++k)
29  fx(k) = fx_fvar(k).val_;
30  }
31  for (int k = 0; k < fx_fvar.size(); ++k) {
32  J(k, i) = fx_fvar(k).d_;
33  }
34  }
35  }
36 
37  }
38 }
39 #endif
void jacobian(const F &f, const Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, 1 > &x, Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, 1 > &fx, Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &J)
Definition: jacobian.hpp:13

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