genalΒΆ
- genal package
- Submodules
- genal.GENO module
Geno
Geno.data
Geno.phenotype
Geno.MR_data
Geno.MR_results
Geno.ram
Geno.cpus
Geno.checks
Geno.name
Geno.reference_panel
Geno.preprocess_data()
Geno.clump()
Geno.prs()
Geno.set_phenotype()
Geno.association_test()
Geno.query_outcome()
Geno.MR()
Geno.MRpresso()
Geno.lift()
Geno.MR()
Geno.MR_forest()
Geno.MR_plot()
Geno.MRpresso()
Geno.association_test()
Geno.clump()
Geno.copy()
Geno.extract_snps()
Geno.get_reference_panel()
Geno.lift()
Geno.preprocess_data()
Geno.prs()
Geno.query_outcome()
Geno.save()
Geno.set_phenotype()
Geno.sort_group()
Geno.standardize()
Geno.update_snpids()
merge_command_parallel()
- genal.MR module
beta_mode()
bootstrap_mode()
bootstrap_mode_iteration()
linreg()
mr_egger_regression()
mr_egger_regression_bootstrap()
mr_ivw()
mr_ivw_fe()
mr_ivw_re()
mr_pen_wm()
mr_sign()
mr_simple_median()
mr_simple_mode()
mr_uwr()
mr_weighted_median()
mr_weighted_mode()
parallel_bootstrap_func()
weighted_median()
weighted_median_bootstrap()
- genal.MR_tools module
- genal.MRpresso module
- genal.association module
- genal.clump module
- genal.extract_prs module
- genal.geno_tools module
- genal.lift module
- genal.proxy module
- genal.tools module
- Module contents